MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bordetella parapertussis 12822 chromosome

Total Repeats: 119926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002928	TCG	2	6	29	34	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594724
2	NC_002928	TGG	2	6	36	41	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594724
3	NC_002928	TGC	2	6	98	103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594724
4	NC_002928	G	6	6	154	159	0 %	0 %	100 %	0 %	33594724
5	NC_002928	GCG	2	6	200	205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594724
6	NC_002928	CGA	2	6	222	227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594724
7	NC_002928	CAG	2	6	364	369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594724
8	NC_002928	GGT	2	6	402	407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594724
9	NC_002928	GTG	2	6	451	456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594724
10	NC_002928	GGGC	2	8	517	524	0 %	0 %	75 %	25 %	33594724
11	NC_002928	C	6	6	532	537	0 %	0 %	0 %	100 %	33594724
12	NC_002928	GCC	2	6	584	589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594724
13	NC_002928	CGC	3	9	602	610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594724
14	NC_002928	GACG	2	8	616	623	25 %	0 %	50 %	25 %	33594724
15	NC_002928	GT	3	6	638	643	0 %	50 %	50 %	0 %	33594724
16	NC_002928	AGC	2	6	650	655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594724
17	NC_002928	CGCA	2	8	751	758	25 %	0 %	25 %	50 %	33594724
18	NC_002928	ATC	2	6	763	768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594724
19	NC_002928	CATC	2	8	836	843	25 %	25 %	0 %	50 %	33594724
20	NC_002928	CCA	2	6	941	946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594724
21	NC_002928	GCCT	2	8	947	954	0 %	25 %	25 %	50 %	33594724
22	NC_002928	CG	3	6	1052	1057	0 %	0 %	50 %	50 %	33594724
23	NC_002928	TTC	2	6	1099	1104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33594724
24	NC_002928	GGC	3	9	1140	1148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594724
25	NC_002928	CTG	2	6	1156	1161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594724
26	NC_002928	GCC	2	6	1174	1179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594724
27	NC_002928	CG	3	6	1259	1264	0 %	0 %	50 %	50 %	33594724
28	NC_002928	GCC	2	6	1358	1363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594724
29	NC_002928	TGG	2	6	1373	1378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594724
30	NC_002928	ACG	2	6	1379	1384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594724
31	NC_002928	CG	3	6	1463	1468	0 %	0 %	50 %	50 %	33594724
32	NC_002928	GCC	2	6	1483	1488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594724
33	NC_002928	CTG	2	6	1495	1500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594724
34	NC_002928	GGCAA	2	10	1501	1510	40 %	0 %	40 %	20 %	33594724
35	NC_002928	CGA	2	6	1587	1592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594724
36	NC_002928	GCTG	2	8	1602	1609	0 %	25 %	50 %	25 %	33594724
37	NC_002928	CG	3	6	1680	1685	0 %	0 %	50 %	50 %	33594724
38	NC_002928	AGC	3	9	1721	1729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594724
39	NC_002928	ACG	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594724
40	NC_002928	CG	4	8	1827	1834	0 %	0 %	50 %	50 %	33594724
41	NC_002928	GCAA	2	8	1904	1911	50 %	0 %	25 %	25 %	33594724
42	NC_002928	CGG	2	6	1940	1945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594725
43	NC_002928	GCCG	2	8	1988	1995	0 %	0 %	50 %	50 %	33594725
44	NC_002928	CAG	3	9	2004	2012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594725
45	NC_002928	GCT	2	6	2015	2020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594725
46	NC_002928	GCA	2	6	2099	2104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594725
47	NC_002928	GTCG	2	8	2120	2127	0 %	25 %	50 %	25 %	33594725
48	NC_002928	CGC	2	6	2153	2158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594725
49	NC_002928	GC	4	8	2167	2174	0 %	0 %	50 %	50 %	33594725
50	NC_002928	CGG	3	9	2198	2206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594725
51	NC_002928	GTG	2	6	2217	2222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594725
52	NC_002928	CAT	2	6	2228	2233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594725
53	NC_002928	GC	3	6	2234	2239	0 %	0 %	50 %	50 %	33594725
54	NC_002928	GAA	2	6	2273	2278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594725
55	NC_002928	GC	3	6	2305	2310	0 %	0 %	50 %	50 %	33594725
56	NC_002928	GTG	2	6	2376	2381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594725
57	NC_002928	GGCC	2	8	2423	2430	0 %	0 %	50 %	50 %	33594725
58	NC_002928	GGT	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594725
59	NC_002928	TCG	2	6	2455	2460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594725
60	NC_002928	TGG	2	6	2542	2547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594725
61	NC_002928	CCGC	2	8	2631	2638	0 %	0 %	25 %	75 %	33594726
62	NC_002928	GCG	2	6	2664	2669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594726
63	NC_002928	ACC	3	9	2678	2686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594726
64	NC_002928	CTGGC	2	10	2703	2712	0 %	20 %	40 %	40 %	33594726
65	NC_002928	AGC	2	6	2721	2726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594726
66	NC_002928	TGC	2	6	2730	2735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594726
67	NC_002928	TCGATC	2	12	2739	2750	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	33594726
68	NC_002928	CCA	2	6	2763	2768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594726
69	NC_002928	CG	3	6	2847	2852	0 %	0 %	50 %	50 %	33594726
70	NC_002928	CGG	2	6	2866	2871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594726
71	NC_002928	ACG	2	6	2874	2879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594726
72	NC_002928	CGAGCG	2	12	2935	2946	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	33594726
73	NC_002928	GCC	2	6	2957	2962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594726
74	NC_002928	GCCC	2	8	3006	3013	0 %	0 %	25 %	75 %	33594726
75	NC_002928	GCT	2	6	3022	3027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594726
76	NC_002928	GCTG	2	8	3040	3047	0 %	25 %	50 %	25 %	33594726
77	NC_002928	TCA	2	6	3060	3065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594726
78	NC_002928	CAA	2	6	3145	3150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33594726
79	NC_002928	TTG	2	6	3170	3175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33594726
80	NC_002928	GCA	3	9	3205	3213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594726
81	NC_002928	CAC	2	6	3256	3261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594726
82	NC_002928	GGT	2	6	3262	3267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594726
83	NC_002928	GTG	2	6	3317	3322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594726
84	NC_002928	CG	3	6	3329	3334	0 %	0 %	50 %	50 %	33594726
85	NC_002928	CG	3	6	3336	3341	0 %	0 %	50 %	50 %	33594726
86	NC_002928	GC	3	6	3342	3347	0 %	0 %	50 %	50 %	33594726
87	NC_002928	TGCT	2	8	3420	3427	0 %	50 %	25 %	25 %	33594727
88	NC_002928	GCC	2	6	3434	3439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594727
89	NC_002928	GGGAG	2	10	3457	3466	20 %	0 %	80 %	0 %	33594727
90	NC_002928	GC	3	6	3470	3475	0 %	0 %	50 %	50 %	33594727
91	NC_002928	GGC	2	6	3484	3489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594727
92	NC_002928	CCA	2	6	3498	3503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594727
93	NC_002928	GC	5	10	3565	3574	0 %	0 %	50 %	50 %	33594727
94	NC_002928	TCG	2	6	3729	3734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594727
95	NC_002928	GGC	2	6	3757	3762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594727
96	NC_002928	CGT	2	6	3766	3771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594727
97	NC_002928	ACG	2	6	3861	3866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594727
98	NC_002928	GC	3	6	3890	3895	0 %	0 %	50 %	50 %	33594727
99	NC_002928	GGC	2	6	3901	3906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594727
100	NC_002928	GCT	2	6	3925	3930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594727
101	NC_002928	GCG	2	6	3945	3950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594727
102	NC_002928	GGC	2	6	3970	3975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594727
103	NC_002928	CGC	2	6	4017	4022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594727
104	NC_002928	GCG	2	6	4024	4029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594727
105	NC_002928	GCG	2	6	4041	4046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594727
106	NC_002928	CGG	2	6	4047	4052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594727
107	NC_002928	GCCA	2	8	4076	4083	25 %	0 %	25 %	50 %	33594727
108	NC_002928	GC	4	8	4089	4096	0 %	0 %	50 %	50 %	33594727
109	NC_002928	GCC	2	6	4130	4135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594727
110	NC_002928	AAG	2	6	4269	4274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594728
111	NC_002928	ACA	2	6	4333	4338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33594728
112	NC_002928	CCG	2	6	4371	4376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594728
113	NC_002928	CCTG	2	8	4382	4389	0 %	25 %	25 %	50 %	33594728
114	NC_002928	GC	3	6	4400	4405	0 %	0 %	50 %	50 %	33594728
115	NC_002928	CGCGCA	2	12	4420	4431	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	33594728
116	NC_002928	GC	3	6	4441	4446	0 %	0 %	50 %	50 %	33594728
117	NC_002928	CAT	2	6	4481	4486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594728
118	NC_002928	GTGC	2	8	4500	4507	0 %	25 %	50 %	25 %	33594728
119	NC_002928	ATC	2	6	4539	4544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594728
120	NC_002928	CG	3	6	4563	4568	0 %	0 %	50 %	50 %	33594728
121	NC_002928	GGCC	2	8	4577	4584	0 %	0 %	50 %	50 %	33594728
122	NC_002928	AAG	2	6	4588	4593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594728
123	NC_002928	CGA	2	6	4619	4624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594728
124	NC_002928	CGC	2	6	4628	4633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594728
125	NC_002928	CGC	2	6	4701	4706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594728
126	NC_002928	CGA	2	6	4712	4717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594728
127	NC_002928	GCC	2	6	4740	4745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594728
128	NC_002928	CCA	2	6	4771	4776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33594728
129	NC_002928	CTG	2	6	4782	4787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594728
130	NC_002928	TGC	2	6	4822	4827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594728
131	NC_002928	GGCG	2	8	4829	4836	0 %	0 %	75 %	25 %	33594728
132	NC_002928	GCC	2	6	4878	4883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594728
133	NC_002928	CG	3	6	4952	4957	0 %	0 %	50 %	50 %	33594728
134	NC_002928	CGC	2	6	4976	4981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594728
135	NC_002928	AAG	2	6	4989	4994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33594728
136	NC_002928	CG	3	6	5008	5013	0 %	0 %	50 %	50 %	33594728
137	NC_002928	ATC	2	6	5044	5049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594728
138	NC_002928	CG	3	6	5056	5061	0 %	0 %	50 %	50 %	33594728
139	NC_002928	GCT	2	6	5135	5140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594728
140	NC_002928	CGG	2	6	5211	5216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594729
141	NC_002928	GC	3	6	5228	5233	0 %	0 %	50 %	50 %	33594729
142	NC_002928	GCG	2	6	5249	5254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594729
143	NC_002928	GGC	2	6	5292	5297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594729
144	NC_002928	GGCC	2	8	5310	5317	0 %	0 %	50 %	50 %	33594729
145	NC_002928	GC	3	6	5320	5325	0 %	0 %	50 %	50 %	33594729
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147	NC_002928	GC	3	6	5397	5402	0 %	0 %	50 %	50 %	33594729
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152	NC_002928	GCT	2	6	5520	5525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594729
153	NC_002928	TGA	2	6	5636	5641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33594729
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155	NC_002928	CGC	2	6	5694	5699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594729
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164	NC_002928	CGA	3	9	6042	6050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594729
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172	NC_002928	GAGACG	2	12	6977	6988	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	33594730
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174	NC_002928	TGC	2	6	7051	7056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594730
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243	NC_002928	GAC	2	6	9908	9913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33594734
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252	NC_002928	GCC	2	6	10184	10189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594734
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257	NC_002928	CGT	2	6	10738	10743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594735
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261	NC_002928	GAG	2	6	10951	10956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33594735
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263	NC_002928	GCG	2	6	11071	11076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33594735
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265	NC_002928	GCT	2	6	11266	11271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594736
266	NC_002928	GCC	3	9	11272	11280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33594736
267	NC_002928	GTGGCC	2	12	11281	11292	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33594736
268	NC_002928	TGG	2	6	11304	11309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33594736
269	NC_002928	GCT	3	9	11320	11328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594736
270	NC_002928	TGC	2	6	11354	11359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33594736
271	NC_002928	TCA	2	6	11387	11392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33594736
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